姓  名

陈佳佳

性  别

女

出生年月

1982.10

学  历

博士研究生

职  称

教授

职  务

化生学院教师发展中心主任

电  话

0512-68418938

电子邮箱

njucjj@126.com

【个人简介】

陈佳佳，教授，江苏苏州人，苏州市优秀教育工作者、江苏高校“青蓝工程”优秀青年骨干教师，中国生物信息学会专委会常委，苏州市生物学会理事。2004年获南京大学理学学士学位；2006年获南京大学理学硕士学位；2013年获苏州大学理学博士学位。主讲本科《生物技术制药》等课程；主持完成国家自然科学基金面上项目1项、国家自然科学基金青年项目1项、市厅级课题3项，获授权国家发明专利1项、软件著作权8项、获苏州市自然科学优秀学术论文一等奖，发表SCI论文40余篇，研究成果入选全球医药研究资讯关键科学文章。

【研究领域】

在特定环境条件下生物基因表达特征和调控机理，包括(1)转录组表达谱数据的系统整合；(2)环境应答ceRNA网络构建和通路分析；(3)环境胁迫下基因表达和功能分析；(4)转基因体系的构建。

【项目与获奖】

（一）、承担的科研项目

(1) 国家自然科学基金委员会,   面上项目, 31770903, lncRNA介导的ceRNA调控网络在水稻干旱胁迫应答中的功能研究, 2018.1-2021.12, 60万元, 完成, 主持

(2) 国家自然科学基金委员会,   青年项目, 31400712, 基于microRNA协同调控模块挖掘和验证肾透明细胞癌联合诊断标记, 2015.1-2017.12, 24万元, 完成, 主持

(3) 苏州市科技计划, 农业项目, SNG201905, 氨基酸螯合稀土镧提高水稻抗逆性能的分子机制及应用研究, 2020.1-2022.12, 5万元, 在研, 主持

(4) 江苏省高校自然科学基金,面上项目，13KJB180021，基于microRNA调控网络的新型前列腺癌诊断标记的构建，2014.1-2015.12，完成，主持

(5) 苏州市科技计划, 农业项目, SNG201409, 水稻逆境胁迫应答microRNA标记的筛选及调控机制研究, 2014.7-2017.6, 8万元, 完成, 主持

（二）、获奖成果

2023年6月，苏州科技大学说课竞赛，二等奖

2020年9月，苏州科技大学优秀教学成果奖，二等奖

2020年7月，全国大学生生命科学创新创业大赛，一等奖，指导教师

2019年9月，互联网+创新创业大赛，江苏省三等奖，指导教师

2018年6月，江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师

2018年9月，苏州科技大学优秀教学成果奖，一等奖

2014年9月，苏州市自然科学优秀学术论文，一等奖 

2016年9月，苏州市优秀教育工作者

2008年6月，苏州科技大学青年教师讲课竞赛，一等奖

2018年12月，苏州科技大学青年教师讲课竞赛，一等奖

2013年6月，苏州科技大学微课教学竞赛，一等奖

2013年9月，江苏省微课教学竞赛，三等奖

2014年10月，全国高校微课教学比赛，二等奖

2014年6月，江苏省本科高校青年教师讲课竞赛，二等奖 

2014年9月，青年教师标兵

2014年9月，交行奖教金

2015年1月，苏州科技大学优秀青年骨干教师，考核优秀

2016年9月，苏州科技大学优秀教师       

2018年1月，苏州科技大学优青培养对象  

2018年9月，苏州国际教育园，最佳人气课程奖

【论文、论著及授权专利】

主要代表性论文:

第一作者：

1.          Chen, J, Zhang, Y, Shen, B. Bioinformatics for   the Origin and Evolution of Viruses. Adv Exp Med Biol. 2022;1368:53-71.

2.          Chen, J.,   Zhong, Y.，LncRNA TCONS_00021861 is   functionally associated with drought tolerance in rice (Oryza sativa) via competing   endogenous RNA regulation，BMC Plant Biology，2021.9

3.          Chen, J.,   Zhong, Y., Li, L.:miR‑124 and   miR‑203 synergistically inactivate EMT pathway   via coregulation of   ZEB2 in clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), J Transl   Med, 2020,   18, 2020

4.          Chen, J.,   Zhong, Y., Li, L.:   Integrative analysis reveals drought-responsive microrna-MRNA     regulatory modules in Oryza sativa, Basic & Clinical Pharmacology &     Toxicology, 2018, 124(1), 2018

5.          Chen, J.,   Zhong, Y., Li, L.: Multiple   Regression Analysis Reveals MicroRNA Regulatory   Networks in Oryza   sativa under Drought Stress, Int J Genomics, 2018: 9395261,   2018

6.          Chen, J.,   Lin, Y., Shen, B.:   Informatics for Precision Medicine and Healthcare. Adv Exp   Med   Biol, 1005: 1, 2017

7.          Chen, J.,   Miao, Z., Xue, B. et al.:   Long Non-coding RNAs in Urologic Malignancies:   Functional Roles and   Clinical Translation. J Cancer, 7: 1842, 2016

8.          Chen, J.,   Shen, B.: RNA Bioinformatics   for Precision Medicine. Adv Exp Med Biol, 939:   21, 2016

9.          Chen, J.,   Sun, M., Shen, B.:   Deciphering oncogenic drivers: from single genes to   integrated   pathways. Brief Bioinform, 2014

10.     Chen, J.,   Qian, F., Yan, W. et al.: Translational   biomedical informatics in the cloud:   present and future. BioMed   Research International, 2013: 658925, 2013

11.     Chen, J.,   Shen, B.: Network Biomarkers for Diagnosis and   Prognosis of Human Prostate   Cancer. In: Bioinformatics for Diagnosis,   Prognosis and Treatment of Complex   Diseases: Springer Netherlands, pp.   207-220, 2013

12.     Chen, J.,   Wang, Y., Shen, B. et al.: Molecular signature of   cancer at gene level or   pathway level? Case studies of colorectal   cancer and prostate cancer   microarray data. Computational and   Mathematical Methods in Medicine, 2013:   909525, 2013

13.     Chen, J.,   Zhang, D., Yan, W. et al.: Translational   bioinformatics for diagnostic and   prognostic prediction of prostate   cancer in the next-generation sequencing   era. BioMed Research   International, 2013: 901578, 2013

14.     Chen, J.,   Zhang, D., Zhang, W. et al.: Clear cell renal   cell carcinoma associated   microRNA expression signatures identified by   an integrated bioinformatics   analysis. Journal of Translational   Medicine, 11: 169, 2013

15.     Chen, J.,   Chen, L., Shen, B.: Identification of Network   Biomarkers for Cancer   Diagnosis. In: Bioinformatics of Human   Proteomics. Edited by X. Wang:   Springer Netherlands, pp. 257-275, 2012

16.     Chen, J.,   Shen, B.: Computational analysis of amino acid   mutation: a proteome wide   perspective. Current   Proteomics, 6: 228, 2009

17.     Chen, J.,   Wang, Y., Guo, D. et al.: A systems biology   perspective on rational design of   peptide vaccine against virus   infections. Current Topics in Medicinal   Chemistry, 12: 1310,   2012

18.     Chen, J.,   Zhang, D., Zhang, W. et al.: An integrative   framework for identifying   consistent microRNA expression signatures   associated with clear cell renal   cell carcinoma. Presented at the   Systems Biology (ISB), 2012 IEEE 6th   International Conference on,   Xi'an, China, August 18-20, 2012, 2012

19.     Liu, B., Chen, J., Shen, B.:   Genome-wide analysis of   the transcription factor binding preference of human   bi-directional   promoters and functional annotation of related gene pairs. BMC   Systems   Biology, 5: S2, 2011 (共同一作)

通信作者：

1.          Zhong, Y., Chen,   J.*: Ameliorative   effects of Lanthanum(Ⅲ) on Copper(Ⅱ) stressed rice (Oryza   sativa) and its molecular mechanism   revealed by transcriptome profiling. Plant Physiology and Biochemistry,     2020:152, 2020

2.          Gao, Y., Chen, J.*: Informatics     for Nutritional Genetics and Genomics. Adv Exp Med Biol, 1005: 143,     2017

3.          20.     Shen, Y., Zhang,   S., Zhou, J. Chen, J.*:   Cohort Research in "Omics" and   Preventive Medicine. Adv Exp Med   Biol, 1005: 193, 2017

4.          Yan, W., Wang, S., Sun, Z., Chen,   W., Chen,   J.*: Identification of microRNAs as potential biomarker   for gastric   cancer by system biological analysis. Biomed Res   Int, 2014: 901428,   2014

代表性授权专利：

1.          发明专利 2021.06授权 提高砷胁迫水稻耐受性的microRNA基因及其应用    发明专利 201810191587.7第一作者

以上资料更新日期：2024年2月